La recherche à l’ISEN est répartie sur les trois sites de Brest, Lille et Toulon. Les équipes travaillent dans les thématiques suivantes :
- Acoustique
- Biotechnologies
- Codesign et intelligence collective
- Électronique, Microfluidique et Nanoélectronique
- Énergie et Environnement
- Informatique
- Intelligence ambiante
- Internet des Objets
- Microsystèmes et Microtechnologies
- Physique des matériaux et Nanosciences
- Robotique
- Traitement du signal et de l’image
- Transports